東沙擁有我國海域唯一發育完整的環礁，係由珊瑚礁經千萬年的生長堆積而形成，屬於特殊珍貴自然景觀，足以代表國家自然遺產；東沙環礁孕育豐富的珊瑚礁生物，優美的景觀有「南海之珠」的美譽；也擁有多處古沉船遺蹟，需由國家長期保存。
鑒此內政部於2007年1月成立「東沙環礁國家公園」，在管理組織上 於2007年10月4日設立「海洋國家公園管理處」，統籌東沙環礁及其他可能評估設立的綠島、北方三島、澎湖群島等島嶼或海洋型國家公園。
海洋保育已是世界趨勢與共識，台灣四面環海，海洋將是台灣未來發展的命脈，保護海洋，就是守護台灣。2001年5月行政院核定之「生物多樣性推動方案」中，希望將臺灣地區海洋保護區面積由目前不足領海面積的1%，逐步增加到5%。東沙環礁國家公園及海洋國家公園管理處的成立，除了展示政府重視海洋，以海洋立國之強列企圖心，同時亦向國際社會表達台灣善盡國際義務，實踐人類共同價值之決心。
