一九五○年在台南永福國小宿舍被軍警圍捕，送軍法局，嚴刑逼供，欲誣陷歐陽文為中國共產黨。無法得逞，乃判刑十二年監禁綠島。送綠島監禁前夕，軍法局突然要歐陽文整理包袱，蒙上眼睛，驅車載至當時的國防醫學院學生解剖室。歐陽文被綁在解剖台，才被告知要進行盲腸炎開刀。沒有經過麻醉，軍醫就在歐陽文肚子，劃開十五公分，連續三次拉出腸管，供在場醫學院男女學生觀摩。軍法局同時電告歐陽文家人，偽稱歐陽文患急性盲腸炎，正進行手術，危險性極高，可能性命不保等。
被非人道迫害的歐陽文，靠著堅強的毅力沒有死在解剖台上，隨便縫合傷口後，被送到軍醫院「療傷」。歐陽文為了求生，強忍「手術」後的乾渴，不敢聽從軍護士多次要他喝下大杯冷水的命令，因為歐陽文親族有好幾位醫生，他稍具醫學常識；手術後未放氣前，不可飲食。僥倖未死的「療傷」期間，蔣宋美齡正好來巡視傷兵，所有傷兵都整齊坐起，等待被一一慰問。只有歐陽文雙眼緊閉，仍躺床榻，不願起身。蔣宋美齡來到床前，以手撫摸歐陽文胸口，輕聲問：「傷口還痛嗎？」洞悉國民黨欲置其於死地的歐陽文，仍然緊閉雙眼，絲毫不為所動。
